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Blood:PU.1编码基因所在染色质区域的动态三维结构

2018/10/14 作者:MedSci   来源:MedSci原创 我要评论0
Tags: PU.1  三维结构  拓扑关联域  LDB1  
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中心点:

PU.1编码基因的空间染色质结构,在髓系分化过程中动态重构,在AML中被破坏。

PU.1自动调节启动空间重构,并招募LDB1来稳定PU.1基因调控DNA元件之间所形成的染色质环。

摘要:

基因表达的表观遗传调控发生在被称为拓扑关联域(TADs)的离散空间染色体单元内,但大多数基因的精确的空间要求尚未明确;该点对与癌症相关的基因特别有意义。

Daniel Schuetzmann等人采用高分辨率的染色质构象捕获测序,尝试在健康单核细胞和急性髓系白血病(AML)细胞中绘制编码关键髓系转录因子PU.1的人基因座的三维(3D)结构图。

研究人员确定了一个动态的大约75kb大小的单位(SubTAD)作为基因组区域,该区域内PU.1基因调控元件之间的空间互作发生在髓系分化过程中,并在AML中被破坏。在该SubTAD内,空间染色质互作的合理启动需要PU.1自动调控以及招募染色质衔接蛋白LDB1(LIM结构域结合蛋白1)。但是,这些空间互作一旦发生,LDB1就可不依赖PU.1自动调节而稳定它们。

因此,研究人员得出结论,PU.1通过启动稳定的染色质环,以“打了就跑”的方式自动调节其表达,从而形成转录活跃的染色质结构。


原始出处:

Daniel Schuetzmann,et al. Temporal auto-regulation during human PU.1 locus SubTAD formation. Blood  2018  :blood-2018-02-834721;  doi: https://doi.org/10.1182/blood-2018-02-834721

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所属期刊:BLOOD 影响因子:15.132 期刊论坛:进入期刊论坛
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